А жителей города кто-нибудь спрашивал, что именно они хотят? Мост и эстакаду, запирающие город от моря и влезающие в классические виды или тоннель малость подороже, но с сохранением облика и характера города?
Без меня меня женили?

Если Вы внимательно посмотрите ту же самую статью в вики, то увидите, что проект тоннеля из погружаемых секций, предлагаемый вначале, был вдвое дешевле горнопроходческого варианта (даже без учета щита)
И это притом, то в рассматриваемом месте глубина Невы наибольшая, ~24 метров.
Т.е. оказался бы ~40 миллиардов. Это из расчета 3.5 км.

От северного берега Невской губы до Крестовского и далее до Васильевского глубины незначительны, в среднем 1.5-3 метра с отдельными фарватерами до 10 м.
Поэтому погружаемый тоннель был бы еще куда дешевле в постройке.

Однако, как в Орловском проекте стали волюнтаристски рассматривать лишь горнопроходческий вариант, отметя погружаемый по надуманным предлогам, так и здесь его даже и не обсуждали. Очевидно нет наверху у него "своих людей". Т.е. именно что "вторая" из озвученных причин.